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Tomato locus Solyc01g097190
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Locus | Solyc01g097190 |
Locus name | Solyc01g097190 |
Symbol | Solyc01g097190 |
Gene activity | |
Description | Ankyrin repeat protein-like (AHRD V1 ***- Q6K268_ORYSJ); contains Interpro domain(s) IPR002110 Ankyrin |
Chromosome | 1 |
Arm |
|
|
![]() ![]() |
Registry name: | None | [Associate registry name] |
![]() ![]() | [Add notes, figures or images] |
Image | Description | Type |
---|
![]() ![]() | [Associate accession] |
Accession name:
Would you Like to specify an allele?
Alleles (0) | None | [Add new Allele] |
![]() ![]() | [Associate new locus] |
Associated loci - graphical view | None |
![]() ![]() |
![]() ![]() |
![]() ![]() |
![]() ![]() | unprocessed genomic sequence region underlying this gene |
>Solyc01g097190.2 SL2.50ch01:88125140..88138340
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TCACGAGAAAAAGAAGGGCGGCAGCCAGCAGCCTCAGTCGAGAGCTTCAGGAGAGAGAAGGGAAAGAAAGTCGCGAGGAG
AGAAGGGAAAAAGAGTCGCGAGGAGAGAAGGGAAAGAAGAGTTGTGAGGAGAGAGAAGTTATATTTCAGATTTGTTTTTA
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GTCGCTTCTCGCTTCTTCCTCTGAAGCGAGTGCTTTTTTCAAATCGCCTCGCCTCAAGTTAAAAAAGCGCACTAGGGTCG
CCTCGCTTTGAAGCGCGCTTTTTTGCGCTTTTAACAACACTGGTAATTAGGCAGTGAGACAATCAATAATTATGTTGAAT
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TGCATGTTGAGACTTGAAGCTCTTCATTTAGCAGATGCAGTAGTTACTATATCCATGTTTTTCTCATTGTCGTGCGGTAC
TGATATGATTGCAGGGAAGCTGTCGAGGCTGGTAGAAAAGTTCATGCCACAAACAAGGTTGATTCGCCGTCCTAGAGTTA
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GGCATGCCTTTTTTGGATAGTTCCAAATGGATTATATAATGGTGGAGATGGGGTTGTAGAAGAAGAAGAAGAAAGAGAGA
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GGCGGGAGTTATCTCAAATGACCTAAAATATCAAAGAATCAATGCGAACTTGGGAATACATACAAAACAATAGATGCAAA
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TATTTGATTTTGAGGCTCTTATTTATTGGTTGATTAATATGTGCTGAAAGTGATATTTCTGTATACTGATTTGGATATGT
TGTTCATCGTAGGTGAGACTCCTCTTCTTCATGCTGCTAGGCAAGGGCACACTACTACTGTCCAGTACCTCTTGGAACAG
GGTGCAGATCCTGCAATACCCAGCGCCTCGGGGGCAACAGCTTTGCATCATGCTGCAGGAAATGGTAGGTTCTTCCTCTT
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CTCAATTGATGACTTGAAATAACCCTAGATTTCTAGAGCTTTAAAGAGCCGACATAACTCAAAAACGTTAGCTGATATTG
TTATTATGAGAATTAAATCACTATATAGCTGAAGATGTTGTAATGAAGCTGTCTATACTTCCGTGTCTCATTTGTTTGTT
CTTATCTACTGATGAAAGTGTATTACTAAGAAGATCAGTCTAAGTTAACCCTACGAGGAACATAAAATTTGGATTGTTGG
TCATATAACTAGCCTTTGCTGTGTTCATAACAAACACGTTATGAGATGTCTTCATCTCAATATATCATGATTGATAGGAA
GATTTTTTTTCCCCAAGCTGTTGAAGCTTGAAGACAAGCAAGAGTAGCTTTGCTGGCTGGAAAAAGTCCAACTTCTCCTC
CCCATTATATCAAAGGATGCATGTGCAGTTATATTTTTCCTGGATAAAACTCTTGTTTCTAAAGAAAAACTCTAAATGGC
CGGAATCTGAGAAAGTGGATCTACTATTTCAGCAACCGTGTTCATTGTAGAGCATAGCTCTGTTGCTATTATAAGCTGCT
CCCTCCATTTTTACTTTGAATCCATTCGTTTTACTTGACATGATGAATAAGAAGACAATTGAAGATAGCTGTTTCTTTAC
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GCTTGATCTGAATTTTTGGGGCTATATAAAGGATGCATGAATATTACAGAAGACTTTAGAAAGGAGGTGCACGAGTAGAA
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TGATAGCCTGTGGGGATCTCTGCTGCAATTTTTTAATCATCATAAGCCTATCTGTTCTGCCACATCCTTTTCACTTAATC
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TGGTTTATCCCTTGTATACGTCCAACTTGGCCATGTTTATGAATGGAACACTTTTACCTTATCCACCTTGTTGGCACATA
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TTATGATGGATATCAGTAGTTGAGGTCTTAGTGTCAGCTTTAACTTCTCTATTGGTAAAACAATGAGAGAAATCAATCGA
CATGTCATTCCTTATTGCTTTATTGTTATTTATTGTGGTGTTGATGTGTGTAGTAACATGCACTCTTCAATTTATTTGTA
TTTCTTTACATAGAGGGACACTTCATTGTGCATTGTCTCTGTTTGCAGGACATGTTGAATTGGTTAAGTTGTTACTGTCA
AAGGGTGTAGATGTTGATTTACAAAGTGAGGCTGGAACACCGCTTATGTGGGCTGCAGGTTTCGGCCAGGAAGAGGTTGT
CAAGGTTTTGCTGGAACATCATGCTAATGTGAGTGCTTTATTACCTATTTGAACCCCTCTTTCTCAATTTAACAATACCA
GTTATTGTTTAACTGTTTTTTTGTCAATACAATAAAGCCATAAAAAATTCATCAACCTTTAAAAAAACCCATCCCTTCTC
TTTTTTCATCTAACACATTTTTAACGGCTAGCCAAGGTGGTGCATTTTCTAAACCGCCATGGCAGCCTAATACAGTGTAG
AGTTTCCACTCCCAACCTGCCCACTCTTTTTCTCTCACCCACTCCCCTCTTATCTTTTTTCTGTATTTGATAAAAATAAT
TACAAAAAAATTTGGCTCAATTTGACTATCATCTTTCATGCTTTAGTTCCAGTTAGGGCGTGTTTAGTATGGAGGAACAT
ATTTTTGGGAAAATGTTTTCCAATTTGTTCATGTTTAGATGGTCAAAGTTTTTAGAAAATATTTTCTTTAGAAAAATAAG
TTGTTTAAAAATGAGGAAAATGACTTTCTAAATGGAAGTAAGAAAAACTAGTTCTACCCTGGCATTCCACTCCCCTCTAC
ACCCTTCAATACACCTCATCTTCACTCCCACATCTCTGTAGCCCCATCTCCACTTCCACTTTCCTATCCACCGTTCAACA
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TATATAAATAGTTTTAGGATAGTATTTTTGCCTATATACCGAACACAAAAAAATAAATAAGAAACCCATTTATTTTCCTA
GAAAAGATTTTCGGGGAGAACATTTCCTTGCTACCATACACACCCTTAGTTGTTTTTTAATGTTTGTGTTGCAAAAAAAG
AAGTTAGCTTAGATATATGGAGAACTGTTCCTGTTTGTATCTGTTGGACAATTTGCAAGGAGAGGAATGCTATAGATGTT
TAATTCTCAAAAAAGGGAATGCTATCGTTGTTTTGATAGCATGGAGAATAGTATGCAAAAGGTTAAGCTAAAGTACCTTT
TGCTACTATGTTTTTGGTGTAATCAAATCTATTCAAATGACATTATCTCCATAATTGACAATTTAGGTAGGAGTTAGCAG
GATTTTGAAGTAAAATTATGTAAATTTGGTTTTCAGTGCATACTTATGTACTGTTTGTGAGAAATATATGAAGTCACCCG
TCCCAAAGAAAAAAGAGTTAGCTTAGATATAGTATATACTGTAAACAACAATTCTTGATTAGTTGATTCAACTAAAGATA
AATTTTCTTTCATAAGTTAAATTAGATCAATTCTATATTGCATACAGCCCCTGTTTTGCATTTTTTACTTGTTAGAGAGG
GCATGTATTGATAATATTTGGAAAACCCAATTCCTCCCCCTCCCCCCCTCCAATGTTGATGCACTCCTTTTGTAGTTTAT
GTGATGTAGTTTTACTTGACACGAAGTTTAAGAAAAGAAAAAATGGCTTTTGAAATTTGTGGTCCAAAATAAGTCATAGA
TGTTTGTTGCTATAAATCATTTCATTAAGGTATAATGGAAATTTTAAAGTTAAATGTTTATTAAAAATAGAAGCATGTCT
TTCTTTTTGGGACCAACTAAAAAGGAAAGTGAGTCCTATAAATTAGAACAGGGGGAGTATCTCTATTTGTTCATTTGGCC
TAAAAAGTTACTTTGTGCAGGTTCATACTCAAACAGAAGATGAAAATAATGTCTGTCCTTTGGTATCAGCTGTAGCAACC
GATTCATTGCCTTGCGTGGAGCTGTTAGTGAAGGTCAATAAATTATATTTTTTCTATATTCATTAGATTGTTCTACTTCT
TCACTTTATCTACTTTAAATTGCTGAATCCAATTGAGCATCCTGAAGAAGTTGTGTTGCAGAAAACATATAGTGCTTTTG
TTTGATGTATTTTCACTCTGCCGTCTGCTATGTGTTGGAACCATGCAAGATTTGTGCTAAGATTAAACCACAAGAAACTG
CTTTGATCATATGAGCTATGTGAGACTTGGCTCTATTACCCCTTAGAGTTTTTCTTTCCTGAAACTTTTAACTTCTATCT
GCTTCTTTATCTGAGTTTTTCTTTCCTGAAACTCTTAACTTCTATTCTGTTTTTTTTTATCTTTTTAATATTTGTTTGAA
AGTTAAGTTTAAACATGCTTAAAAGAATAGAACAATTGAGAGATACCCCTCGAAAATTAAACAAGTAAAACTGCTAAAGA
TAAAAGGGGAAAATATTCAATTTGTGTACATTCAGTTTATACCAGCATTAAGTGGTGAAGGGTAAAAAGGGTGGGTTCAT
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ACATATTTTAACCTCAATTTTACAGGCGAAACAAGCCTTTTAAAACACAATGTTACAATATAAAGCTTAGACTTAAATTA
GACTTCAGCTTTCAGGTTTATCTAATTAGGTAATTCAAACATTTCTTTACCTTTTGCCTTTCTGTGGAAATGGTTTCCTA
AAGTACTTGAGGAGCAAAGTTTGATCTCCTCTGCTTGTTAAATCTGCAATTGTTGTTAATAGCTCACATCAATGTTGCAT
TTATTTCAATGATTTTCTTTTAGTTCTCTCTTTTTGTTTCTGAGATGTAGGAGAGGCTTTGCTTAAGAGCTTTATGACTG
GTTAAGCCCAATATAGAAAAAATTTCTTGACCACATCGTTTTATGAATATTGTGCACCTTACTTGTCGGGGCATAAGCCA
AGGCAAGAACCCAACTACCTTTGTCAACATAGCCACACCTTATTTAAATTGATAAAGCGAAAGCATACAATTCGGAGGGA
GTTTAGATAGTAGATAAACACATAAAAAACGCTCAATATTGCTTAATTAGTTTTGATCCAATAAAATAATGTAATTAATG
TCGTTAATAATGTAATTGCAAGATGGGGGTGCTTACTACTATTTATCTTGGTCTATCACTTGTAGCATCTTATAAGGACC
AAAGAGTTATAGGTTCTGATGATTGAGAGGGTAGAAATGAGATTATCTGACTATAAAAGAGATGCTAAAAATATCGTTCT
ATCTTGAAAGAGTGGGACGAGTCCTTTGGTTATGTATCATTTAGGGTAGGTGATGGGTGTAGGATACGTTATAGAGATAC
AACACCTGCGGGAACAAGTACATTTACAAATATGTATATAGTTTCATGCCAAAAGGAGATGTCAATTCAACGAACTCAAA
GGGTCCAAGGTTAAGAAACTCATATGGAATTGAGGATTTAGGAGGAACTTGCAAGATTGTGAGGTTTTGGAATTTCAGTC
TAGTTAAGACACTTCAGGAAAAAGTTCCTCACCAGCTAGCCGTGATGTACAAAAATGCGGAGTGAGAATAATGGCATCTT
TTTGTAAGTCCTACTATTAGAATTTTCTAGGTATGTAAGAGTACACTTCTCCAGATTTTTGGTGTTCCATTTCACGTGGC
TATCATGTGTAGAAGCTTTCATGAAGATGTGAATCATCTTCTTCACATTATGTATCAATCTTGCTTAGAAGCTTGGCTGT
CATTTATAGAAATCATATCTTTTTTAAGGTTCTGTACTGTTTTATATTCTTCTTGTATATGTATATTTTCTTTCCCATTG
CTAATACAATTTATTCTTTGATATAAACCAAAGTTATTGGTAAATTTTGCTTTTGGTCCTTGTGATAAGACTGGGGATAT
TTAACATTCAATTATTCAAGATGTGTGTTTTTGGCCCCTTCATGTGAAAATATGTTATATTTGACTATTTACAGAATTAC
ATTACCATCAAGTATGGAGTAACAATACAAATTTAACATATTACATGAGTAATTAGCAGTGTTTTGGGAAGCGAGAAGCG
GAAAAAAGCGACAAGGGCTTGCTTCACAGAAGCGTGAAGCGAAGCGCGCACTTTTTTAAAAAAAAGCGACATTTAGTATA
AAAATAAAAAAATATTAAATAACTAAAAAGAGGTAATATAGTCTTAGATTGAAAGAAATTACTTGGGCAAAAATACTCAC
AAGTCATAACATATAAAGCAAAAAATCAAAAACATAATTAGATCACAAAATACTACAAACAAAAGGAAGTTTCAGAAAAT
AATAAAAAAAGGCTGCTAGCATACACACTGATCACAAAATAAAAAAAAACAAAAGAATTGAAAAAAAAACAGAGGTAGCA
GTCAGTAAGAACTAAGAAGAAAAGAGCAGGCAGCAGAGAATAGAGATGAAGAAAAGAAGAGAAGAAGAAGAAAAAAGAGA
TGAACAAATTACCTGCAAGCCTCAGTCGAGATCTTGAGGAGAGAAAGAAGGGAGGCAGCCAGCAGCCTCAGTCGAGATCT
TCACGAGAAAAAGAAGGGCGGCAGCCAGCAGCCTCAGTCGAGAGCTTCAGGAGAGAGAAGGGAAAGAAAGTCGCGAGGAG
AGAAGGGAAAAAGAGTCGCGAGGAGAGAAGGGAAAGAAGAGTTGTGAGGAGAGAGAAGTTATATTTCAGATTTGTTTTTA
AAAATACCTATTTTTTTTAAAAAAACCCTAATTGTCGCTTTTTTTATAAAAAGCACGTTTTTTTGCGCTTTTTCCTCAGC
GTCGCTTCTCGCTTCTTCCTCTGAAGCGAGTGCTTTTTTCAAATCGCCTCGCCTCAAGTTAAAAAAGCGCACTAGGGTCG
CCTCGCTTTGAAGCGCGCTTTTTTGCGCTTTTAACAACACTGGTAATTAGGCAGTGAGACAATCAATAATTATGTTGAAT
TTGTGAATATTCACAAGCAAAGGGATTAAAAATTGCCCAATTCAATCAATTGGAGAAGTTAATGGAATTGAAAGTCTGAG
TGTTTGGCTCTACTTTGGGACTTCCATTGGAGGTCTCTAAGTTTGAAACCCCTTGCTAGCAAAAGCAAGTGGTTTGGCTT
CTGGGCCAAGCTCGTCGAACCAGGCTAGCTTAGTGCGGGTTACCTCTCATGTGTATGGTTTGCGAGCTATTGTATAGGAG
CGGATGTTTTACTATGCGTGCACCCAAGGGTGGCGGCTGCGGGTTTCTCTTGTCATAAAAAAATAGGAAATAGATAATAT
ATGATCATGTTGTTCCCAAAGAATTACTGTTTATAAGCTCTTCTTTGATCTTCCTTTTTTATCCGATGATTCCATTTGAA
GTTGCGCATGTTCTACTTTTAGTCCCTTGAAGATACAGAGTACAACTGGCATGTTTGGTTCTTAATCCAAGATGCTGGAG
GAAACATTGCTTACATATTCAAAGATGGTTTATTGTGTAAAACAATCTTTTCTATCTACTTATCCAAAAAGGGAAAAAGA
AAGAAAATTCATTTCCTCCCTGAAAAGCAATTTGTGCATATGCTACTCCAGATTGGAACTGTTGTATGCGGGACCATCTA
TTTCACTTATTGAAACTGTCTTTTTCAATTTTCCACTTTGGTTTGGATTTTGCTATGTTGCTTGGTTAAGCATGCCGCCT
GTCTACTCAAGGCTTAACTTCTTTTATGCTACCATACAGGCAGGGGCTGATGTCAATGTTAGGACTGGTGATGCAACTCC
TTTGCTCATTGCTGCTCATAATGGTAGTGCAGGAGTCATTAACTGCTTACTACAAGCTGGAGCTGATCCGAATGCGGCTG
AGGAGGTAATTGAAAGAAAATCTAAAGGAATATAGTGTTCTTTATTATTTCACATATTTTGGAAGAAATATCCAAGGACT
CTTTATAATGTTGGAAAGTTGATTCCAAATAATTTTAGTTTTATTTTCGTGGCTTCTGTTTGTCAAGAACGTGTCAATTA
TATTCCTTGTTATCACTTTGAGTCTACTACCTCTTATTCCTTTTCAGATTCCCTTGTAGAATCTATGTACCTTGGCCATC
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GTCAGTCGTTCATGATTTTGTTGAGAGATAATTCTATTTTGACTTCATAAGCGTATCACAATTTTTTGTTATTGAATATT
TCATAAATAAATAATTTTAAAAAATATACACCATAAATTTGTTGTATTAGAAAAGCAATCCTTATAATACAATACTTTCA
CATTCTCCAATGTAGTATCTTTTCATAGAATATGGATCAAATCTAAGTTGCTTGGACTCTTCACTTTTGGTGCCTCACCC
GTGTCGGCATGACATGGGTATGGGATCCACGTCCGATTTGGTCAACCGGTTTTGGGTACTTCAACCAAAATCGATGGGGA
AAGTCGGGACTAGTTAATGATTTCTATAATCAATACAAAAGTTAAGGTGAAATTGAAGAAAATGGAATACCTTAAAAATT
TCTATTTCACTCCGTCGTTTCCTTTTATCTCCTTCTAGGATTCTTCTTGAGTTTTCTACATAATATCTCATAATTTAGGT
TTTATATCTCTATATTTAGATATTTTAATTATTTTTAGGTGAATCACCCCACCTGTATCCATACATGGATCCGTATCTCC
GATCTTAAAAATTAGATCATGAAGGATCCGGCCTCTAGAGCACCCGTATTGGACATCCGTACTTATGTTCTAATGTGGTG
TCCAGGTTACACCATGCTCCCTATTGTCATTTTGTTACGTAGTAATGAAACCTCTCTTTTTACGACCAAAAAAACCTATA
TCTACCATGGTGTAAGCTTGTTACCCGGCTCAGTGTACTCACATACACACACACACACGCACCAAAAAAAAAAAGAGGAG
AGAGAAAAGAAAAGACATGAATCTTATAATATGGACTGTAGTCTTGTCTTGCTTCTAAAGGTGAATATCCTTTCTGCTCC
ATTGTTGAGCATTAATGAAGAGTACTGCTGCGATTCTCACCATTTGGATATGAAAAGCTCTAGAGAGAGATATCTGGGAT
AAATAAGACATACCTGGCTGAAAAGAGGAATGTCAGTCATAGAACATATTAAACCTAGATTAGGGTTTAGGTATTTTACT
AATTCTGGTTTCTTAACGACCTTTTATAAGAAATTGTAAACCTGGTCATTTTGTTGTATAACAGTCAATCCGATGGGTTT
TCTGGTCTTACTGGTGGATTCTCCGCTCTGACAGGTTTTCAGGTAAACTGTGACCTGTTTCTTTTGGGTTGACAGATCAA
CTGGTCTAATCTGGGGTTCAGAACATTTAAGTGAAGAAAGTGTAGGGGGAGTGCTTAGCTTTGCTGGATCAGACATGATA
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CTTTGAATCTTGATTTCTTCTGGTGAAGCACTCTTGAAGACAGACTTAAAATACTTTCATCGTGAATATGACAATACATC
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TTCATAGGGCTTCAAAATGCATAAAGTTTCTCTTATAGTCAGTGAAGTCATACCAGTGACGTGGTTCCAGACTTCCGTTT
CAGCTGGCTTCAAATTGCACAGAGGATCAATATTTTTTTACACTGTGTTTTTACTTAGGTCTCTCTTTCATTTGAAGAAC
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TTTATAGGTGAGTCCTGAAGCAAAGAAGAAAGCTGCAGATGCAAAGGCGAGGGCAGACGAGGCATTTAATAGGAAAGATT
TTGCTACAGCTATAGATACTTACACGCAGGTACCTATTAGTCTTATTGACCTGAATTCCCAGCTCTACCCTTTCCTCAGT
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G
Download sequence region |
Get flanking sequences on SL2.50ch01
|
![]() ![]() |
![]() ![]() | terms associated with this mRNA |
![]() ![]() | spliced cDNA sequence, including UTRs |
>Solyc01g097190.2.1 Ankyrin repeat protein-like (AHRD V1 ***- Q6K268_ORYSJ); contains Interpro domain(s) IPR002110 Ankyrin
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GTG
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GATGTTGATTTACAAAGTGAGGCTGGAACACCGCTTATGTGGGCTGCAGGTTTCGGCCAGGAAGAGGTTGTCAAGGTTTT
GCTGGAACATCATGCTAATGTTCATACTCAAACAGAAGATGAAAATAATGTCTGTCCTTTGGTATCAGCTGTAGCAACCG
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ATTGCTGCTCATAATGGTAGTGCAGGAGTCATTAACTGCTTACTACAAGCTGGAGCTGATCCGAATGCGGCTGAGGAGGA
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TTCAGAGTGTTCCAGAATGGAGTGTGGATGGAGTGATTGAGTTTGTGCAATCTGAATATAAGAGAGAACAGGAAAGAGCA
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GAAGAAAGCTGCAGATGCAAAGGCGAGGGCAGACGAGGCATTTAATAGGAAAGATTTTGCTACAGCTATAGATACTTACA
CGCAGGCAATCGATTTTGATCCAACTGATGGCACTCTGTTTTCCAATAGAAGTCTTTGTTGGCTCCGCCTGGGCCAAGCT
GAACGCGCCTTAAGTGATGCCAGGGCCTGCAGAGAACTTAGACCAGATTGGGCAAAAGGTTGTTATCGGGAAGGTGCAGC
TCTACGTCTATTGCAGAGGTTTGAAGAGGCAGCCAATGCTTTCTATGAGGGTGTACAGATCAACCCTGATAATATGGAAC
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GATTCGATAATTTGAAAAATTATTAAATTTCGATAATTTTTTTAAAAAAAATATGAATATCATATTCATTTGCTTATATC
GTG
![]() ![]() | translated polypeptide sequence |
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![]() ![]() |
![]() ![]() | [Associate new unigene] |
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Literature annotations [0] | None | [Associate publication] [Matching publications] |
![]() ![]() | [Add ontology annotations] |
![]() ![]() |
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Elements not found:
Optional: Add Missing Accessions to A List
Mismatched case
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Multiple mismatched case
Items listed here have mulitple case mismatches and must be fixed manually. If accessions need to be merged, contact the database directly.
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