SGN Marker hp2
SGN-M4662
KFG markers are Known Function Genes
KFG markers are Known Function Genes
Synonyms |
Locus associations |
Mapped locations |
| Pepper Capsicum |
| Tomato-EXPEN 2000 |
Other PCR data |
|
Overgo hybridization and physical mapping |
hp2 was used as an overgo probe on plate 13 [well D3]
Plausible BAC Matches: P279H04, P336M04, P103N19, P238I13, P248I23, P006E23, P159L11, P264L01, P311M10, P222C02, P299C22, P265P12, P262N19, P179A02, P238B03, P079E01, P139N11, P211G05, P274H08, P197K06, P223D15, P118E13, P017L24
Non-Plausible BAC matches
Overgo Sequences
A sequence
CCTTACTATGCCCTTGCCCTTATC
|
B sequence
GAGTCAGTCCACCAATGATAAGGG
|
AB sequence
CCTTACTATGCCCTTGCCCTTATCATTGGT
|
Marker sequence
ACCTAAACCATATTTGACCAAATCCGTATTTACCCATATCCAATTTGGGT
AGATTGTAACCCAAACCATTTTTGCTCAATCCGATCCAATCCAACCATTT GCCACCCTACTTCCATATACGTTCTCCGTGTAAAGGGAAGAAAACAAGCT GTGCTCTTTAAGAAAATTAAGTTTTTTGTTTTGTTTGGTCGGTATATTTA TCTTCTCCCCCCAACCCTCCCTTAAATTCTCTCTACAGTTTTACACACAG CAATGTGTAAGTAATAGTCCTCTTTGGTTTAGTTTGGCAAGTATTTCTTC ACTTTTCATGCCTCTATATAAAAAAAAAGGAAAAGAAAAGAAAATGTTTC TTGTTTGGTTGTTGAGTGAATTCTCACTTTATGCTTATAATGCTTTCTCC CTTCGTTGGAAAGTGCAGCTTTTTGCTTCGTAGCACCTCCAAACACACTT CCCTATGAAGAGAATTTTCTTTAGATTTGGTGGGTATAGTTCCCTCTTGA CCCTTTAATTTGGTTTTGTATGAATTTCTCTTCATTATTACCCATTTCCT TTATATAGAAAGAAACTTTTGGTTTTGGTGTTTAATATGCTCAGTCAATT TGATCATTCCCTCTAGCAAGGAAAAAAATCTGTTTATTTTATGAAGGAAA AAAGGCCAAAAGCCCTAAAGTGCTCAACTATGGAAAATAGAACAATATTG CCCTCCATTTGAATTTGATCCTTACTATGCCCTTGCCCTTATCATTGGTG GACTGACTCAGATTTGCTCCTCAACTATTGGAAAAAGAACTAATTTGCTG TCCGTATAAATTTGGTCCTAAATTGCCCTCATTGCGGATGAACTTGCTCC AATTTGCCTATCAAAATTAACAGACCCTAAATATTTTATTTTTAAAACAG ATTATATTTAAGTCCCAGTTACAAAAAATAATATTATATTTATTAAAAAA GAGAGTGCTACCCTGAAAGATAATAATCTTAATGCTTAAATGTTCTTGTA 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TGATAACCGTGCCCTTATTGACCCAGTAAACATTAGTGAGTTGGGTCATT GATGCAAAGGATTGGGTGTCGAGCCGAGCTTTAGCGAGCCCAATCGACCT GATCAGTTGAGCTTAGCCTATGTGAACTCTTCAATGTTTAGTTCTATATA CTACTATGTCATTAAAAAATATTTAATTTATAACAAATTGGTTAATCAAG AAAAATAAGTATTAGGGGTCGTTTGATAGGTGTACAAGAATCGTGTTGAG TAGAGTATATTAGTAATGTTGGTATTAATATGTTGACATTATGCGGAGAT TATTTCTTATGCACGGTTTGGTTTGGTGTAAATAACATGCTTTGCATAAT ATCTGAAAATAATTATTTGTTTACAAAAACACCCTCCACAAATGTGTGGG AAGGACGTGGGAACACTAAGGGCAATTGTGTCTTTAACCATGCTAATGCA TGCACTAAAAATCCTCACATTGCTAATACCATTGTTCGTCATCTATCAGT TATACATAGCATGATACCAAAAAGATGTACAAAAAAAAGAAGGTATTAGT AATGCATAAAACTAATGTCTTATTTTTTTTTTCTAATGCATCCTTGCAAA TGACCCTGTAGTATAATTTGGTTATTGCATTCAAGTGTGATTGAATTATA TGTATAATTTGGTTATCGCATTCAAGTGTGATTGAATTCTATGTGTTATT AGTTTAAGTTAGACCTTAAATTTAAATGAAGGTAATTTTATATTAAACAT AGAATAGAATATTCAGAAAAAAATAATATAAAAATCACAATACATTCAAG AAATCTGTACAATATTAATTTTCTTTAATTTTTGAGTTCTTGAACTTAAA ATATTTAATAACATTTTTCACTACCCATAAAATATTTTTAGTAATGATGT CTAAAAAAATAATTACATAAATTTTTTTAAAGGAGTACAAAATAAATTTG TTAATAGTAAATAATAATTATTGAATTAACATCTTGCTAACTTGACTAAG ATTAATGGATTAATTTTTGTTTTAAAGCATGATCAAAACAAGCCAACCAA GCCGGCTCAACCTAGTCCTAGTTTTAATAGAGACTAGCTTAATTTTCACC AAAACTAAGCTGAACTAAATACAGGCGAGAAAAGCCGAGTAGTAACGTGC CATTTGATAACATAGTCTGGGTTGAGAGAGTTATCCTTAGTGGATGAACA TTTCATCTTATATCTAACAATAAGCCGAATCATCTAGGCTTATTTTCTGC AACAGTGGATGATATTTGGTCATTTTGAGCAAGTTGATAGGAGGGTATTT TTGTTTCTTTGCAAATTTCAGATCTAACTGCAGATATATTAATATTGCAA CCATTTTGAGAATAATTTCCAATTAGATTACTGTTAGTCCTTCATGTACA ATCTTGTTTTGTATCATTCTGATACTTCAGAATTTTTTCAGAGCGTGCAA TTTCTTTGCAGCAATTTGTTGGATCTACTCAGCCCTCTCATCCATACCGC AATGTGTATTTTTTTGCTTAATTGCAATATATAAGTGTTAATTCTATATA TAAGTTTGGAAATTTTCTTGTGAGCGGTTTAAATTCCTTATTAGCCTTCT ATTGCAGCTTATTTCAGCTATTGACCGCCATAGACAGTCTACTGACCATC CAATCAAATTCATTTCTAGAAGACAACCCAATATCCTGAAATTCAAAATG AAGCCAGGTACGGACTTTTTTATTTATAATTGTTGACATGCTTCATCTTC TGGTGGTAAAACTTGGCTTGTTTTCTTATGCTGCTTATTATTAAAGTACA TTTACTATCAGGACCTGAAGCTGGCAGCACAGATGGGCGAACTAAGAAGA TCTGTTCCTTCCTCTTCCACCCAATATTACCCCTTGCACTTTCTGTTCAA CAAACCTTGTTTCTGCAGGCATCAGTTGTAAATATCCATTTTCGTCGATA ATGTAAAAACTTAATTTATATGTTACCGATTTGTTTATAAATTTCTCTAA TAACCTCTAGATTGAAATCAACCTAGAAATCACAAATTCATCATAACAGA CCCGTAGATGCTAGTGTCTTTGACTTCTACATTTTCTTTGTTACAAGAAT CAAACAAATGCTTGATAGAGTGCCAAGACGGTTAGTATGGGTATAAGGAT TAGTTCTTCTGTAAGTTTTTGTTACAGCTTCTCTTCTAATTAATTGATGT ACATTCAGATGTTTATTTGTGAGGTAGAAAACTGATGAAGACCCATTTTT GGTTATCTATGGATACTGTAGACTATGGTACACAAAATCTTTTACCTGTA TCAGCTGCTTTGGGATGTTTAAGTCAGAATAAAGGAAGATGACATATAAC TAGATTTTCCATTCGTTGTATTTCTAATTCTGTCAGCATTCCTTTTGGTT TCAATTAGAAAAGCAATATGATGATGCTTGAACGAATTTGGATGAAGCAA GTTCGTGAAGAACTTTTGGTATGAATTAGGAGTGATTAACAGTTAAGTTG AATATAAGTCGATCAAATGTTAAATAAAAATGGGTCAAATGCAGAACTTG CTTCATATTTTAAACGAGTAAAAATGAGTTATCCAAGGGATAATATTGAT AAACATGGATATATATTATTATAGTATAGAGATTGTGCTAAAAGCTAAAG GCGAAATGGTTCTTGTACTTGTGTCTGCTTGTATTATGGACACATCTACT TACCCTTTTTGTCATCCTGACCCTTGAAGCCATCAAACCCACATTTTAAA |
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Genomic location of hp2 |
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