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Solanum lycopersicum gene Solyc09g092160.2

Name Solyc09g092160.2	Type Gene	Organism Solanum lycopersicum
Synonyms / aliases Solyc09g092160	Length 14,863

Description

Beta-galactosidase (AHRD V1 **** A2JGW9_SOLLC); contains Interpro domain(s) IPR001944 Glycoside hydrolase, family 35

Location(s)

SL2.50ch09:71305944..71320806

GFF source

ITAG_eugene

From BOGAS: 1

Length: 14863

Genome Viewer

Related features

Features that are parts of this gene

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
mRNA	Solyc09g092160.2.1	SL2.50ch09:71305944..71320806	2,975	-	n/a

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Genomic sequence

unprocessed genomic sequence region underlying this gene

>Solyc09g092160.2 SL2.50ch09:71320806..71305944 (sequence from reverse strand)
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AGTTCTTCAGTGAGGGTGTAAAGCTTGATGGACATTGCATACTGAAATCTAACTCAAGAACTATGAACCAGGAAAATGTG
GTATATTTGAGCTCATATCCCTTCACTATGCTCTTCTTTATTTTTTATGCCTCCCTCTGATGTATACAACTCAAAAAGGA
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ATATGATTGTGAAAGTTAAGGAAGGCTGAAAGGACTTTATCTGAAAAATAAAGGAAAGGCAGAAAGGAATAAAAGATGGA
CTTCGTTATTTTATGCAAGCATGAATCACTGCGCTTTTAGGATAATATTACTCTCTCCTGCTTACCTTAAATTGTTCTTG
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AAGATTGATTTTTCATTGCAACTCAAGTTGTCTCCTATAACTTCTGAAAAAAATGGTTGAATAAAATGTTTATGACCATT
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GGGAATAATTCTTTGTTTCTACAAGTAATCACTAAAAGCAAGCTCGAAAGTTTTTCACAATCTTGGATGACATTGAAGGA
GCCACTTGGTGTGTGGGGTGACAAGAATTTCACTTCTAAAGGAATACTGGAGCATCTGAATGTGACAAAAGACCAGTCTG
ATTACCTGTGGTATCTGACCAGGTATTTCAATTATAACTGAGGTTAGGTCAGACTAAACAGTGAGTAATACCTTAATTTG
GAACCACTTGATAATGGGACTTCTCCAATTCCATATATAGCTTTAAAACCGCACCGTTTATACCACATTCTTAGATGGCA
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TGCGTGCCTGTCTTTGTATATTTGTTTGTGTTTTTTTCCCTTTTTATCCCCTATACTAATATACTTTGGCTTCTGTATCA
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GACATCCTTTCATTTCTCCATACCAAGTAAGAGTGATGTGAACTTTTTTGACCGTTTTCTTTCATGTAACGAGAAACTCG
GAGTACAAAATGGAAAATTTTCAATGGGTCAAGGACCTTTCATTCTCACTTCAACCAATCAATTGACTATGCATGCCTCA
GCTTCAAATTAACTGGAGCCAGCTATATGAATTTCTTTGAATCCACTGTGTTCTGTTGGGGCCCATTTCGTTGCAATACG
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ATAGCCAGAATAAAAGGACTTCCAATAAACATCGGTTCAAATGTAAGTGCGTGTAACAACTACCACTAAGCATTTTTTGG
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TCATTGATTGAAGAGGGGATCAAAGAAATATTCGCTGTTTGACTTCTTCTGTGCCTATTGATTGCTCCATAGCTAGATAC
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AGCTTGTAGATTAGGAATTCTCTACAATCCTTTTCATTTCTTTGTTCCTATGCTACTGCAGAATTTCTTGGAACATGTGC
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ACCACTCTGATAAATGTAGGACAAACTGTGGAGAGATTACTCAGGCCTGGTATGAACTTCTTTTACTTGCTGAAATTATA
ATTTACATTCTCGGGAATTTGGCGCTCATGATTGTAAGAGGCTACACCTGTGTAGGTGCAGTGAAATGGATCTAAGCTGG
TACATTCTGTTGCTTATAAAGATACTTTTTTTTGACCAGGTACCATATACCTAGATCATGGCTAAAGACATTAAATAATG
TACTAGTTATCTTTGAAGAAACAGATAAAACTCCGTTTGATATTTCCATTTCTACGCGTTCTACTGAAACCATTTGTGCT
CAAGTATCGGAAAAGCACTATCCACCTCTACATAAGTGGTCTCATTCGGAGTTTGACAGAAAGTTGTCTCTGATGGATAA
AACACCAGAAATGCACTTGCAGTGTGACGAAGGACATACAATCTCTTCTATTGAATTTGCAAGCTATGGAAGTCCGAATG
GCAGCTGTCAAAAGTTCTCACAAGGAAAATGCCATGCTGCAAATTCCTTGTCTGTTGTATCTCAGGTATGTTCATTTGTT
TCCTTTTTTCATTTCTTAAAATCGTTTCTATGTTCACCTCTCTTCGTTACAGTATGTTGACTGCAAGAATAGATAAATGT
ATCCCTTGCAGATACTAAGTTACTTCATGATTGATTTTTAATTAGTTTGACAAGTAGATCAACCTTTATAATTAAGAACT
GCAAAGAGAATAGGGTTTCCTTCGTTTGATTAACACGTGATGATTTTTTAAATTAGTGATAGCTATATACCAGGTGGATG
TACAGATGTTTCAATTACAAGAGACATGTCAGGCTAAACAATGCATGAAAACTTGACTGTTTTGATTGGGAGTTAAATCT
TGATGTTCCTTTCTAATAGAGCAATATATTTACTGCTTGACTTCGAATTCACTGTTATATTTGTACAGCAGAGTAAAAAT
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CATTTCCAATGGTGTATTTGGAGATCCATGTCGACACGTTGTGAAGAGTTTGGCTGTTCAAGCAAAATGCTCACCACCAC
CAGACCTCAGCACTTCAGCTTCCTCGTGAGGAGACTCTGGTAACACGTTAACCTTTTAGAACGAAACGATCCCTTAAAGT
CCACTCGTTCCCCTGCCCCCGAGCCCTCTGCTACATTTCTCAGATCGCATCGTTACAATCAGGCGGAGAAAACGTACATG
GACGATTTTACTTGTAAATATTTGGTTACTGTATATAAAATGAAAGGAATAATGTTGCTTATGCATATGAGCTGCAAATT
ATATGACAAAGTAACAAATGAAAATAGAAAACTCCTGTCTGTCAAAGAATTTTAACAACACCA

Download sequence region

Download sequence (15Kb)

Get flanking sequences on SL2.50ch09

mRNA Solyc09g092160.2.1

Ontology terms

terms associated with this mRNA

GO:0004565 – beta-galactosidase activity

cDNA sequence

spliced cDNA sequence, including UTRs

>Solyc09g092160.2.1 Beta-galactosidase (AHRD V1 **** A2JGW9_SOLLC); contains Interpro domain(s) IPR001944 Glycoside hydrolase, family 35
ATCCATTTTCATCTGAGACAAAATGGTAGAAGCTATGAGCAGAAGAAAAACACTGAATTTTCCGTTAATACTAACGGTGT
TAACTATCCACTTTGTGATCGTCGCCGGCGAGTATTTCAAGCCGTTCAATGTCACCTACGATAACCGAGCTCTCATCATC
GGCGGTAAACGCCGTATGCTTATCTCCGCCGGAATTCACTACCCTCGCGCCACTCCTGAGATGTGGCCCACATTGATAGC
TAGGAGCAAAGAAGGTGGTGCAGATGTCATCGAGACTTATACATTTTGGAATGGTCATGAGCCAACCAGGGGACAGTACA
ATTTTGAAGGAAGATATGATATTGTCAAGTTTGCAAAGCTAGTCGGATCTCATGGACTGTTCCTCTTTATTCGAATAGGT
CCTTATGCCTGTGCAGAATGGAACTTCGGGGGATTCCCCATATGGCTTCGTGATATACCTGGAATAGAATTTCGAACAGA
TAATGCACCATTCAAGGAGGAGATGGAGCGCTATGTTAAAAAGATAGTTGATCTTATGATATCTGAGTCGCTCTTTTCGT
GGCAAGGTGGTCCTATCATTTTGCTGCAGATTGAAAATGAATATGGAAATGTTGAAAGCTCATTCGGTCCCAAGGGGAAG
TTATATATGAAATGGGCTGCTGAAATGGCTGTTGGTCTTGGTGCTGGTGTTCCATGGGTCATGTGCAGGCAAACTGATGC
TCCAGAATACATCATAGATACTTGTAATGCATACTATTGTGATGGGTTCACGCCGAATTCCGAGAAGAAACCGAAAATTT
GGACTGAGAATTGGAATGGATGGTTTGCAGATTGGGGTGAAAGACTTCCATATAGACCTTCCGAGGATATTGCATTTGCA
ATTGCTCGTTTCTTTCAACGTGGGGGCAGCTTACAGAACTATTATATGTATTTTGGTGGGACAAATTTTGGCCGGACTGC
TGGTGGCCCAACTCAAATCACTAGCTATGATTATGATGCTCCACTGGATGAATATGGACTACTACGTCAACCTAAATGGG
GCCATTTGAAGGATCTGCATGCTGCTATAAAGCTTTGTGAACCAGCTCTTGTTGCTGCTGATTCACCTCAGTATATTAAA
CTGGGACCAAAACAGGAGGCACATGTCTATCGTGGAACATCCAACAACATTGGCCAATATATGTCCTTAAATGAAGGCAT
ATGCGCAGCATTTATTGCAAATATTGATGAACATGAATCAGCAACAGTGAAATTTTACGGTCAAGAGTTCACTTTACCTC
CATGGTCAGTGAGTATTCTGCCAGATTGCAGAAATACAGCTTTCAACACAGCTAAGGTGGGGGCACAAACTTCAATCAAA
ACAGTGGGCTCAGATTCTGTTTCAGTTGGGAATAATTCTTTGTTTCTACAAGTAATCACTAAAAGCAAGCTCGAAAGTTT
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ATCTGAATGTGACAAAAGACCAGTCTGATTACCTGTGGTATCTGACCAGGATATATATTTCTGATGATGACATCTCATTT
TGGGAGGAAAATGATGTTAGTCCAACAATTGATATTGATAGCATGCGTGATTTTGTTCGCATTTTTGTTAATGGGCAGCT
TGCAGGTAGTGTGAAAGGCAAATGGATCAAGGTGGTTCAACCTGTTAAGCTGGTTCAGGGATACAACGACATACTGCTAT
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ACAGGATGCAAAAGCGGGGATATCAATCTCACAACATCTTTATGGACCTACCAGGTGGGGCTTAGAGGCGAATTCCTGGA
AGTATATGATGTCAATAGTACTGAAAGTGCAGGATGGACTGAGTTTCCCACTGGTACAACTCCGTCAGTCTTTTCGTGGT
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TGCTTACCACTCTGATAAATGTAGGACAAACTGTGGAGAGATTACTCAGGCCTGGTACCATATACCTAGATCATGGCTAA
AGACATTAAATAATGTACTAGTTATCTTTGAAGAAACAGATAAAACTCCGTTTGATATTTCCATTTCTACGCGTTCTACT
GAAACCATTTGTGCTCAAGTATCGGAAAAGCACTATCCACCTCTACATAAGTGGTCTCATTCGGAGTTTGACAGAAAGTT
GTCTCTGATGGATAAAACACCAGAAATGCACTTGCAGTGTGACGAAGGACATACAATCTCTTCTATTGAATTTGCAAGCT
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GCTTGTATAGGAAGAACTAGTTGCAGCATTGGCATTTCCAATGGTGTATTTGGAGATCCATGTCGACACGTTGTGAAGAG
TTTGGCTGTTCAAGCAAAATGCTCACCACCACCAGACCTCAGCACTTCAGCTTCCTCGTGAGGAGACTCTGGTAACACGT
TAACCTTTTAGAACGAAACGATCCCTTAAAGTCCACTCGTTCCCCTGCCCCCGAGCCCTCTGCTACATTTCTCAGATCGC
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